You are here

    • You are here:
    • Home > The importance of genome architecture for cell identity

The importance of genome architecture for cell identity

NEWS

15
May
Wed, 15/05/2019 - 19:32

The importance of genome architecture for cell identity

How cells acquire different identities has long fascinated biologists.

EN ESPAÑOL - EN CATALÀ

How cells acquire different identities has long fascinated biologists. During cell development and differentiation, environmental cues trigger signal transduction pathways that result in the activation of specific transcription factors. These in turn determine the epigenetic landscape and gene expression program characteristic of each cell type.

Recent technological advances in the study of 3D chromatin folding have brought cell-specific genome conformation to the fore. A hotly debated topic is the role of chromatin architecture in gene expression: is it only a by-product of changes in transcription or does it have an informational value in itself?

In a review in the May 16 issue of Nature, the researchers Ralph Stadhouders, CRG Alumni now at Erasmus MC, in Rotterdam, the Netherlands, Guillaume Filion and Thomas Graf, of the Centre for Genomic Regulation (CRG), in Barcelona, Spain, discuss recent evidence, including a study performed at the CRG, indicating that it goes both ways: the continuous interplay between genome conformation and transcriptional changes is a driving force for cell-fate decisions. Understanding how the genome folds within the tiny space of the nucleus and how this differs between specialized cells has profound implications for developmental disorders and cancer.

For more information and interviews, please, contact:  Gloria Lligadas, Head of Communications & PR, Centre for Genomic Regulation (CRG) – gloria.lligadas@crg.eu  – Tel. +34 933160153 – Mobile +34608550788 

Reference: Stadhouders R, Filion G, Graf T. "Transcription factors and 3D genome conformation in cell-fate decisions." Nature, 569:345–354 (2019). https://doi.org/10.1038/s41586-019-1182-7 

Funding acknowledgements: Guillaume Filion and Thomas Graf are supported by the European Research Council under the 7th Framework Programme FP7/2007-2013 (ERC Synergy Grant 4D-Genome, grant agreement 609989). Ralph Stadhouders is supported by the Netherlands Organization for Scientific Research (VENI 91617114) and an Erasmus MC Fellowship.


EN ESPAÑOL

La importancia de la arquitectura del genoma para la identidad celular

Cómo las células adquieren identidades distintas fascina a los biólogos desde hace mucho tiempo. Durante el desarrollo y la diferenciación celular, señales ambientales desencadenan vías de transferencia de material genético de señales que resultan en la activación de factores de transcripción específicos. Estos, a su vez, determinan el paisaje epigenético y el programa de expresión génica característico de cada tipo de célula.

Avances tecnológicos recientes en el estudio del plegamiento de la cromatina en 3D ha hecho pasar al primer plano la conformación del genoma de una célula en particular. Un tema debatido acaloradamente es el papel de la arquitectura de la cromatina en la expresión génica: ¿se trata sólo de una consecuencia de los cambios en la transcripción o tiene un valor informativo en si misma?

En una revisión publicada en el número de mayo de la revista Nature, los investigadores Ralph Stadhouders, alumni del CRG, que ahora está en Erasmus MC, en Rotterdam, Holanda, Guillaume Filion y Thomas Graf, del Centro de Regulación Genómica (CRG), en Barcelona, analizan pruebas recientes, incluyendo un estudio llevado a cabo en el CRG, donde indican que se trata de ambas cosas: la continua interacción entre la conformación del genoma y los cambios transcripcionales son una fuerza impulsora para las decisiones que tienen que ver con el destino celular. Comprender cómo el genoma se pliega en el minúsculo espacio dentro del núcleo celular y cómo esto difiere entre células especializadas tiene profundas implicaciones para las enfermedades del desarrollo y el cáncer.

Para más información:  Gloria Lligadas, Directora de Comunicación y RRPP, Centro de Regulación Genómica (CRG) –  gloria.lligadas@crg.eu  – Tel. +34 933160153 – Móvil +34608550788 

Referencia: Stadhouders R, Filion G, Graf T. "Transcription factors and 3D genome conformation in cell-fate decisions." Nature, 569:345–354 (2019). https://doi.org/10.1038/s41586-019-1182-7

Información sobre la financiación de este estudio: Guillaume Filion y Thomas Graf han recibido apoyo del Consejo Europeo de Investigación (ERC) en el contexto del 7º Programa Marco FP7/2007-2013 (ayuda ERC Synergy “4D-Genome”, convenio de la ayuda 609989). Ralph Stadhouders recibe apoyo de la Netherlands Organization for Scientific Research (VENI 91617114) y es beneficiario de una beca Erasmus MC. 


EN CATALÀ

La importància de l’arquitectura del genoma per a la identitat cel·lular

Com les cèl·lules adquireixen identitats distintes fascina als biòlegs des de fa molt temps. Durant el desenvolupament i la diferenciació cel·lular, senyals ambientals desencadenen vies de transferència de material genètic de senyals que resulten en l’activació de factors de transcripció específics. Aquests, per la seva part, determinen el paisatge epigenètic i el programa d’expressió gènica característic de cada tipus de cèl·lula.

Avenços tecnològics recents en l’estudi del plegament de la cromatina en 3D ha fet passar al primer pla la conformació del genoma d’una cèl·lula en particular. Un tema debatut acaloradament és el paper de l’arquitectura de la cromatina en l’expressió gènica: es tracta només d’una conseqüència dels canvis en la transcripció o té un valor informatiu en si mateixa?

En una revisió publicada en el número de maig de la revista Nature, els investigadors Ralph Stadhouders, alumni del CRG, que ara està a Erasmus MC, a Rotterdam, Holanda, Guillaume Filion i Thomas Graf, del Centre de Regulació Genòmica (CRG), a Barcelona, analitzen proves recents, incloent un estudi dut a terme al Centre de Regulació Genòmica (CRG), a Barcelona, on indiquen que es tracta d’ambdues coses: la contínua interacció entre la conformació del genoma i els canvis transcripcionals és una força impulsora per a les decisions que tenen a veure amb el destí cel·lular. Comprendre com el genoma es plega en el minúscul espai dins del nucli cel·lular i com això difereix entre cèl·lules especialitzades té profundes implicacions per a les malalties del desenvolupament i el càncer.

Para a més informació i entrevistes, si us plau contacteu a:  Glòria Lligadas, Directora de Comunicació i Relacions Públiques, Centre de Regulació Genòmica (CRG) - gloria.lligadas@crg.eu – Tel. +34 93 316 01 53 – Mòbil +34 608 550 788  

Referència: Stadhouders R, Filion G, Graf T. "Transcription factors and 3D genome conformation in cell-fate decisions." Nature, 569:345–354 (2019). https://doi.org/10.1038/s41586-019-1182-7

Informació sobre finançament d’aquests estudi: Guillaume Filion i Thomas Graf han rebut suport del Consell Europeu de Recerca (ERC) en el context del 7è Programa Marc FP7/2007-2013 (ajut ERC Synergy “4D-Genome”, conveni de l’ajut 609989). Ralph Stadhouders rep suport de la Netherlands Organization for Scientific Research (VENI 91617114) i és beneficiari d’una beca Erasmus MC.